通过深度学习将 L1000 图谱转换为类似 RNA 的图谱
L1000 技术是一种具有成本效益的高通量转录组学技术，已被应用于分析一组人类细胞系对 > 30,000 种化学和遗传扰动的基因表达反应。目前总共有超过 300 万个可用的 L1000 配置文件。这样的数据集对于发现候选药物和靶标以及推断小分子的作用机制非常宝贵。L1000 检测仅测量 978 个标志性基因的 mRNA 表达，而通过计算可靠地推断出另外 11,350 个基因。缺乏全基因组覆盖限制了一半人类蛋白质编码基因的知识发现，以及与其他转录组学分析数据整合的潜力。
机器之心 · 2022-09-19 18:43:00
